Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ephb1Q8CBF3 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ephb1Q8CBF3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ephb1Q8CBF3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ephb1Q8CBF3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ephb1Q8CBF3 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ephb1Q8CBF3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ephb1Q8CBF3 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ephb1Q8CBF3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ephb1Q8CBF3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ephb1Q8CBF3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ephb1Q8CBF3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ephb1Q8CBF3 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ephb1Q8CBF3 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ephb1Q8CBF3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ephb1Q8CBF3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ephb1Q8CBF3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ephb1Q8CBF3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ephb1Q8CBF3 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ephb1Q8CBF3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ephb1Q8CBF3 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ephb1Q8CBF3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ephb1Q8CBF3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ephb1Q8CBF3 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ephb1Q8CBF3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ephb1Q8CBF3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ephb1Q8CBF3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ephb1Q8CBF3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ephb1Q8CBF3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ephb1Q8CBF3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ephb1Q8CBF3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ephb1Q8CBF3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ephb1Q8CBF3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ephb1Q8CBF3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ephb1Q8CBF3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ephb1Q8CBF3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ephb1Q8CBF3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ephb1Q8CBF3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ephb1Q8CBF3 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ephb1Q8CBF3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ephb1Q8CBF3 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ephb1Q8CBF3 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ephb1Q8CBF3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ephb1Q8CBF3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ephb1Q8CBF3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ephb1Q8CBF3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ephb1Q8CBF3 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ephb1Q8CBF3 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ephb1Q8CBF3 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ephb1Q8CBF3 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Ephb1Q8CBF3 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ephb1Q8CBF3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ephb1Q8CBF3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ephb1Q8CBF3 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ephb1Q8CBF3 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ephb1Q8CBF3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ephb1Q8CBF3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ephb1Q8CBF3 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ephb1Q8CBF3 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ephb1Q8CBF3 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ephb1Q8CBF3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ephb1Q8CBF3 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
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Ephb1Q8CBF3 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
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Ephb1Q8CBF3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Ephb1Q8CBF3 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Ephb1Q8CBF3 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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