Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6E1

Apol7c, Apolipoprotein L 7c, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7cQ8C6E1 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apol7cQ8C6E1 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apol7cQ8C6E1 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apol7cQ8C6E1 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apol7cQ8C6E1 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apol7cQ8C6E1 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apol7cQ8C6E1 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apol7cQ8C6E1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apol7cQ8C6E1 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apol7cQ8C6E1 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apol7cQ8C6E1 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apol7cQ8C6E1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apol7cQ8C6E1 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apol7cQ8C6E1 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apol7cQ8C6E1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apol7cQ8C6E1 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apol7cQ8C6E1 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apol7cQ8C6E1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apol7cQ8C6E1 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Apol7cQ8C6E1 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Apol7cQ8C6E1 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apol7cQ8C6E1 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apol7cQ8C6E1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apol7cQ8C6E1 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apol7cQ8C6E1 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apol7cQ8C6E1 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apol7cQ8C6E1 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apol7cQ8C6E1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apol7cQ8C6E1 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apol7cQ8C6E1 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apol7cQ8C6E1 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apol7cQ8C6E1 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apol7cQ8C6E1 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apol7cQ8C6E1 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apol7cQ8C6E1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apol7cQ8C6E1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apol7cQ8C6E1 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms