Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0R0

Usp37, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 37, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp37Q8C0R0 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp37Q8C0R0 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms