Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXZ0

Ctxn3, Cortexin-3, mousemouse

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Length 80 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctxn3Q8BXZ0 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctxn3Q8BXZ0 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms