Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn17Q8BXA6 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms