Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJU0

Sgta, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgtaQ8BJU0 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SgtaQ8BJU0 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms