Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG0

Slc30a8, Zinc transporter 8, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc30a8Q8BGG0 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc30a8Q8BGG0 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc30a8Q8BGG0 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc30a8Q8BGG0 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc30a8Q8BGG0 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc30a8Q8BGG0 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc30a8Q8BGG0 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc30a8Q8BGG0 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc30a8Q8BGG0 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc30a8Q8BGG0 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc30a8Q8BGG0 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc30a8Q8BGG0 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc30a8Q8BGG0 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Slc30a8Q8BGG0 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc30a8Q8BGG0 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Slc30a8Q8BGG0 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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Slc30a8Q8BGG0 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc30a8Q8BGG0 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc30a8Q8BGG0 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc30a8Q8BGG0 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc30a8Q8BGG0 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Slc30a8Q8BGG0 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Slc30a8Q8BGG0 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc30a8Q8BGG0 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc30a8Q8BGG0 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc30a8Q8BGG0 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc30a8Q8BGG0 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc30a8Q8BGG0 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc30a8Q8BGG0 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc30a8Q8BGG0 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc30a8Q8BGG0 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Slc30a8Q8BGG0 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc30a8Q8BGG0 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc30a8Q8BGG0 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc30a8Q8BGG0 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Slc30a8Q8BGG0 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Slc30a8Q8BGG0 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc30a8Q8BGG0 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc30a8Q8BGG0 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Slc30a8Q8BGG0 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc30a8Q8BGG0 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc30a8Q8BGG0 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc30a8Q8BGG0 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc30a8Q8BGG0 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc30a8Q8BGG0 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Slc30a8Q8BGG0 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc30a8Q8BGG0 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc30a8Q8BGG0 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc30a8Q8BGG0 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc30a8Q8BGG0 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc30a8Q8BGG0 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc30a8Q8BGG0 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc30a8Q8BGG0 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc30a8Q8BGG0 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc30a8Q8BGG0 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc30a8Q8BGG0 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc30a8Q8BGG0 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc30a8Q8BGG0 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc30a8Q8BGG0 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Slc30a8Q8BGG0 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc30a8Q8BGG0 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc30a8Q8BGG0 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc30a8Q8BGG0 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc30a8Q8BGG0 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc30a8Q8BGG0 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms