Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Atg4bQ8BGE6 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Atg4bQ8BGE6 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Atg4bQ8BGE6 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Atg4bQ8BGE6 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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