Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

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Length 757 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
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Htatsf1Q8BGC0 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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Htatsf1Q8BGC0 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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Htatsf1Q8BGC0 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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Htatsf1Q8BGC0 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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Htatsf1Q8BGC0 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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Htatsf1Q8BGC0 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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Htatsf1Q8BGC0 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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Htatsf1Q8BGC0 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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Htatsf1Q8BGC0 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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Htatsf1Q8BGC0 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms