Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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