Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Lrfn4Q80XU8 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Lrfn4Q80XU8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Lrfn4Q80XU8 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrfn4Q80XU8 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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