Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clec18aQ7TSQ1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clec18aQ7TSQ1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clec18aQ7TSQ1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clec18aQ7TSQ1 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clec18aQ7TSQ1 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clec18aQ7TSQ1 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clec18aQ7TSQ1 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clec18aQ7TSQ1 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Clec18aQ7TSQ1 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clec18aQ7TSQ1 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Clec18aQ7TSQ1 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clec18aQ7TSQ1 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clec18aQ7TSQ1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clec18aQ7TSQ1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clec18aQ7TSQ1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clec18aQ7TSQ1 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clec18aQ7TSQ1 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clec18aQ7TSQ1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clec18aQ7TSQ1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clec18aQ7TSQ1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clec18aQ7TSQ1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clec18aQ7TSQ1 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clec18aQ7TSQ1 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clec18aQ7TSQ1 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clec18aQ7TSQ1 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clec18aQ7TSQ1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clec18aQ7TSQ1 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clec18aQ7TSQ1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clec18aQ7TSQ1 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Clec18aQ7TSQ1 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clec18aQ7TSQ1 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clec18aQ7TSQ1 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Clec18aQ7TSQ1 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clec18aQ7TSQ1 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clec18aQ7TSQ1 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clec18aQ7TSQ1 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clec18aQ7TSQ1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clec18aQ7TSQ1 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Clec18aQ7TSQ1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clec18aQ7TSQ1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Clec18aQ7TSQ1 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clec18aQ7TSQ1 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clec18aQ7TSQ1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clec18aQ7TSQ1 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clec18aQ7TSQ1 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clec18aQ7TSQ1 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clec18aQ7TSQ1 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clec18aQ7TSQ1 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clec18aQ7TSQ1 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clec18aQ7TSQ1 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clec18aQ7TSQ1 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clec18aQ7TSQ1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clec18aQ7TSQ1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clec18aQ7TSQ1 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clec18aQ7TSQ1 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clec18aQ7TSQ1 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clec18aQ7TSQ1 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Clec18aQ7TSQ1 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Clec18aQ7TSQ1 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms