Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

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Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dsg1bQ7TSF1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Dsg1bQ7TSF1 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Dsg1bQ7TSF1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Dsg1bQ7TSF1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Dsg1bQ7TSF1 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Dsg1bQ7TSF1 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Dsg1bQ7TSF1 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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