Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ckap2lQ7TS74 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ckap2lQ7TS74 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ckap2lQ7TS74 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ckap2lQ7TS74 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ckap2lQ7TS74 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ckap2lQ7TS74 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ckap2lQ7TS74 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ckap2lQ7TS74 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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