Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TwistnbQ78WZ7 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms