Protein–RNA interactions for Protein: Q76LS9

Mindy1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy1Q76LS9 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms