Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms