Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDJ1

Cachd1, VWFA and cache domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cachd1Q6PDJ1 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Cachd1Q6PDJ1 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Cachd1Q6PDJ1 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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