Protein–RNA interactions for Protein: Q6P7W0

Senp6, Sentrin-specific protease 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp6Q6P7W0 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Senp6Q6P7W0 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms