Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZM9

Hdac4, Histone deacetylase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac4Q6NZM9 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac4Q6NZM9 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms