Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZC7

Sec23ip, SEC23-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23ipQ6NZC7 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms