Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms