Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE8

Znf280d, Zinc finger protein 280D, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf280dQ68FE8 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Znf280dQ68FE8 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf280dQ68FE8 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf280dQ68FE8 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf280dQ68FE8 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf280dQ68FE8 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms