Protein–RNA interactions for Protein: Q66X19

Nlrp4e, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4E, mousemouse

Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4eQ66X19 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp4eQ66X19 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms