Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
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