Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CcncQ62447 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CcncQ62447 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CcncQ62447 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CcncQ62447 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CcncQ62447 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcncQ62447 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcncQ62447 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcncQ62447 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcncQ62447 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CcncQ62447 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcncQ62447 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms