Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tpd52Q62393 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms