Protein–RNA interactions for Protein: Q62148

Aldh1a2, Retinal dehydrogenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a2Q62148 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aldh1a2Q62148 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms