Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Usf1Q61069 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Usf1Q61069 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Usf1Q61069 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Usf1Q61069 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Usf1Q61069 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Usf1Q61069 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Usf1Q61069 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usf1Q61069 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Usf1Q61069 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Usf1Q61069 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usf1Q61069 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Usf1Q61069 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usf1Q61069 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usf1Q61069 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usf1Q61069 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usf1Q61069 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usf1Q61069 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usf1Q61069 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usf1Q61069 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usf1Q61069 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usf1Q61069 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usf1Q61069 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usf1Q61069 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usf1Q61069 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Usf1Q61069 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usf1Q61069 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usf1Q61069 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Usf1Q61069 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usf1Q61069 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usf1Q61069 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Usf1Q61069 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms