Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms