Protein–RNA interactions for Protein: Q5H8B9

Frem3, FRAS1-related extracellular matrix protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frem3Q5H8B9 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Frem3Q5H8B9 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Frem3Q5H8B9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms