Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms