Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Trappc3lQ4KL14 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms