Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0J4

Ankrd53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd53Q3V0J4 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Ankrd53Q3V0J4 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Ankrd53Q3V0J4 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Ankrd53Q3V0J4 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Ankrd53Q3V0J4 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ankrd53Q3V0J4 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms