Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rnpc3Q3UZ01 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnpc3Q3UZ01 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms