Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fchsd2Q3USJ8 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms