Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf224Q3UIW8 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf224Q3UIW8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf224Q3UIW8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf224Q3UIW8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf224Q3UIW8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf224Q3UIW8 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf224Q3UIW8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf224Q3UIW8 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf224Q3UIW8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf224Q3UIW8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf224Q3UIW8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf224Q3UIW8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf224Q3UIW8 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf224Q3UIW8 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf224Q3UIW8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf224Q3UIW8 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf224Q3UIW8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf224Q3UIW8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf224Q3UIW8 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf224Q3UIW8 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf224Q3UIW8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf224Q3UIW8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf224Q3UIW8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf224Q3UIW8 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf224Q3UIW8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf224Q3UIW8 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf224Q3UIW8 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf224Q3UIW8 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf224Q3UIW8 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf224Q3UIW8 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf224Q3UIW8 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf224Q3UIW8 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf224Q3UIW8 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf224Q3UIW8 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf224Q3UIW8 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf224Q3UIW8 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf224Q3UIW8 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf224Q3UIW8 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf224Q3UIW8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf224Q3UIW8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf224Q3UIW8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf224Q3UIW8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf224Q3UIW8 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf224Q3UIW8 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf224Q3UIW8 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf224Q3UIW8 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf224Q3UIW8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf224Q3UIW8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf224Q3UIW8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf224Q3UIW8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf224Q3UIW8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf224Q3UIW8 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf224Q3UIW8 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf224Q3UIW8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf224Q3UIW8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf224Q3UIW8 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf224Q3UIW8 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf224Q3UIW8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf224Q3UIW8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf224Q3UIW8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf224Q3UIW8 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf224Q3UIW8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf224Q3UIW8 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf224Q3UIW8 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf224Q3UIW8 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf224Q3UIW8 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf224Q3UIW8 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf224Q3UIW8 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf224Q3UIW8 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf224Q3UIW8 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf224Q3UIW8 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf224Q3UIW8 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf224Q3UIW8 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf224Q3UIW8 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf224Q3UIW8 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf224Q3UIW8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf224Q3UIW8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf224Q3UIW8 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf224Q3UIW8 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf224Q3UIW8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf224Q3UIW8 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf224Q3UIW8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf224Q3UIW8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf224Q3UIW8 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf224Q3UIW8 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf224Q3UIW8 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf224Q3UIW8 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf224Q3UIW8 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf224Q3UIW8 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf224Q3UIW8 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf224Q3UIW8 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf224Q3UIW8 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf224Q3UIW8 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf224Q3UIW8 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf224Q3UIW8 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf224Q3UIW8 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf224Q3UIW8 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf224Q3UIW8 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf224Q3UIW8 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms