Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc34Q3UI66 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms