Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hace1Q3U0D9 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms