Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL44

Nlrx1, NLR family member X1, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrx1Q3TL44 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms