Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Spatc1Q148B6 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Spatc1Q148B6 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Spatc1Q148B6 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Spatc1Q148B6 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Spatc1Q148B6 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Spatc1Q148B6 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Spatc1Q148B6 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Spatc1Q148B6 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Spatc1Q148B6 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Spatc1Q148B6 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Spatc1Q148B6 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Spatc1Q148B6 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Spatc1Q148B6 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Spatc1Q148B6 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Spatc1Q148B6 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Spatc1Q148B6 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Spatc1Q148B6 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Spatc1Q148B6 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Spatc1Q148B6 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Spatc1Q148B6 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Spatc1Q148B6 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Spatc1Q148B6 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Spatc1Q148B6 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Spatc1Q148B6 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Spatc1Q148B6 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spatc1Q148B6 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spatc1Q148B6 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spatc1Q148B6 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spatc1Q148B6 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spatc1Q148B6 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spatc1Q148B6 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spatc1Q148B6 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spatc1Q148B6 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spatc1Q148B6 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spatc1Q148B6 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spatc1Q148B6 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spatc1Q148B6 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spatc1Q148B6 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spatc1Q148B6 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spatc1Q148B6 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spatc1Q148B6 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Spatc1Q148B6 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Spatc1Q148B6 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Spatc1Q148B6 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spatc1Q148B6 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spatc1Q148B6 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spatc1Q148B6 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spatc1Q148B6 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spatc1Q148B6 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spatc1Q148B6 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spatc1Q148B6 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spatc1Q148B6 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spatc1Q148B6 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spatc1Q148B6 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spatc1Q148B6 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spatc1Q148B6 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spatc1Q148B6 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spatc1Q148B6 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spatc1Q148B6 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spatc1Q148B6 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spatc1Q148B6 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spatc1Q148B6 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spatc1Q148B6 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spatc1Q148B6 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spatc1Q148B6 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spatc1Q148B6 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spatc1Q148B6 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spatc1Q148B6 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spatc1Q148B6 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spatc1Q148B6 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spatc1Q148B6 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spatc1Q148B6 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spatc1Q148B6 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spatc1Q148B6 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spatc1Q148B6 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spatc1Q148B6 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spatc1Q148B6 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spatc1Q148B6 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spatc1Q148B6 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spatc1Q148B6 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spatc1Q148B6 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spatc1Q148B6 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spatc1Q148B6 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spatc1Q148B6 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spatc1Q148B6 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spatc1Q148B6 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spatc1Q148B6 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spatc1Q148B6 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spatc1Q148B6 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Spatc1Q148B6 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Spatc1Q148B6 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Spatc1Q148B6 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Spatc1Q148B6 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Spatc1Q148B6 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Spatc1Q148B6 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Spatc1Q148B6 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Spatc1Q148B6 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Spatc1Q148B6 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Spatc1Q148B6 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms