Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG18

Smim24, Small integral membrane protein 24, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim24Q0VG18 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim24Q0VG18 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms