Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sox13Q04891 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox13Q04891 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sox13Q04891 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sox13Q04891 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sox13Q04891 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox13Q04891 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox13Q04891 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox13Q04891 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sox13Q04891 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox13Q04891 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox13Q04891 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox13Q04891 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox13Q04891 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox13Q04891 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox13Q04891 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox13Q04891 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Sox13Q04891 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sox13Q04891 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox13Q04891 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sox13Q04891 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sox13Q04891 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sox13Q04891 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox13Q04891 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sox13Q04891 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox13Q04891 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sox13Q04891 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sox13Q04891 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sox13Q04891 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox13Q04891 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Sox13Q04891 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox13Q04891 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox13Q04891 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sox13Q04891 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sox13Q04891 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sox13Q04891 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sox13Q04891 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Sox13Q04891 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox13Q04891 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox13Q04891 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox13Q04891 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox13Q04891 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox13Q04891 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox13Q04891 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sox13Q04891 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Sox13Q04891 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sox13Q04891 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sox13Q04891 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox13Q04891 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox13Q04891 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sox13Q04891 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sox13Q04891 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sox13Q04891 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sox13Q04891 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sox13Q04891 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox13Q04891 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sox13Q04891 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox13Q04891 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sox13Q04891 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sox13Q04891 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Sox13Q04891 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox13Q04891 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox13Q04891 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sox13Q04891 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox13Q04891 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox13Q04891 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sox13Q04891 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox13Q04891 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox13Q04891 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox13Q04891 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox13Q04891 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox13Q04891 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sox13Q04891 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sox13Q04891 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox13Q04891 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox13Q04891 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox13Q04891 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sox13Q04891 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox13Q04891 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sox13Q04891 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox13Q04891 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox13Q04891 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox13Q04891 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sox13Q04891 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sox13Q04891 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Sox13Q04891 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox13Q04891 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox13Q04891 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox13Q04891 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox13Q04891 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox13Q04891 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sox13Q04891 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox13Q04891 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox13Q04891 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox13Q04891 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox13Q04891 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Sox13Q04891 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sox13Q04891 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sox13Q04891 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sox13Q04891 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms