Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox8Q04886 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms