Protein–RNA interactions for Protein: Q02357

Ank1, Ankyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ank1Q02357 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ank1Q02357 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ank1Q02357 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ank1Q02357 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ank1Q02357 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ank1Q02357 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ank1Q02357 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ank1Q02357 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ank1Q02357 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ank1Q02357 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ank1Q02357 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ank1Q02357 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ank1Q02357 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ank1Q02357 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ank1Q02357 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ank1Q02357 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ank1Q02357 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ank1Q02357 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ank1Q02357 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ank1Q02357 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ank1Q02357 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ank1Q02357 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ank1Q02357 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ank1Q02357 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ank1Q02357 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ank1Q02357 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ank1Q02357 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ank1Q02357 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ank1Q02357 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ank1Q02357 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ank1Q02357 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ank1Q02357 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ank1Q02357 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ank1Q02357 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ank1Q02357 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ank1Q02357 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ank1Q02357 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ank1Q02357 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ank1Q02357 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ank1Q02357 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ank1Q02357 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ank1Q02357 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ank1Q02357 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ank1Q02357 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ank1Q02357 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ank1Q02357 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ank1Q02357 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ank1Q02357 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ank1Q02357 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ank1Q02357 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ank1Q02357 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ank1Q02357 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ank1Q02357 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ank1Q02357 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ank1Q02357 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ank1Q02357 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ank1Q02357 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ank1Q02357 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ank1Q02357 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ank1Q02357 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ank1Q02357 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ank1Q02357 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ank1Q02357 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ank1Q02357 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ank1Q02357 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ank1Q02357 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ank1Q02357 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ank1Q02357 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ank1Q02357 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ank1Q02357 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ank1Q02357 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ank1Q02357 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Ank1Q02357 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ank1Q02357 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ank1Q02357 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ank1Q02357 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ank1Q02357 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ank1Q02357 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ank1Q02357 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ank1Q02357 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ank1Q02357 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ank1Q02357 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ank1Q02357 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ank1Q02357 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ank1Q02357 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ank1Q02357 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ank1Q02357 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ank1Q02357 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ank1Q02357 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ank1Q02357 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ank1Q02357 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ank1Q02357 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ank1Q02357 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ank1Q02357 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ank1Q02357 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ank1Q02357 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ank1Q02357 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ank1Q02357 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ank1Q02357 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ank1Q02357 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms