Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Taf1bP97358 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Taf1bP97358 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Taf1bP97358 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf1bP97358 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf1bP97358 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf1bP97358 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf1bP97358 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf1bP97358 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf1bP97358 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf1bP97358 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf1bP97358 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf1bP97358 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf1bP97358 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf1bP97358 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf1bP97358 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf1bP97358 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf1bP97358 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf1bP97358 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf1bP97358 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf1bP97358 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf1bP97358 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf1bP97358 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf1bP97358 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf1bP97358 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf1bP97358 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf1bP97358 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf1bP97358 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf1bP97358 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf1bP97358 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf1bP97358 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf1bP97358 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf1bP97358 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf1bP97358 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf1bP97358 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf1bP97358 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf1bP97358 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf1bP97358 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms