Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Gbx1P82976 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
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Gbx1P82976 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Gbx1P82976 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
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Gbx1P82976 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Gbx1P82976 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gbx1P82976 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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