Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms