Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Msx3P70354 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Msx3P70354 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Msx3P70354 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msx3P70354 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Msx3P70354 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msx3P70354 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Msx3P70354 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Msx3P70354 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msx3P70354 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msx3P70354 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Msx3P70354 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Msx3P70354 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msx3P70354 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msx3P70354 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msx3P70354 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msx3P70354 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Msx3P70354 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msx3P70354 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msx3P70354 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msx3P70354 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Msx3P70354 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msx3P70354 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msx3P70354 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Msx3P70354 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msx3P70354 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Msx3P70354 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msx3P70354 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msx3P70354 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msx3P70354 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msx3P70354 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msx3P70354 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Msx3P70354 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Msx3P70354 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Msx3P70354 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msx3P70354 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Msx3P70354 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msx3P70354 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Msx3P70354 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msx3P70354 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msx3P70354 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msx3P70354 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Msx3P70354 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Msx3P70354 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msx3P70354 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Msx3P70354 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Msx3P70354 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Msx3P70354 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msx3P70354 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msx3P70354 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msx3P70354 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Msx3P70354 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msx3P70354 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msx3P70354 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msx3P70354 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msx3P70354 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msx3P70354 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msx3P70354 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msx3P70354 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msx3P70354 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Msx3P70354 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msx3P70354 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msx3P70354 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msx3P70354 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Msx3P70354 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Msx3P70354 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Msx3P70354 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msx3P70354 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Msx3P70354 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msx3P70354 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Msx3P70354 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msx3P70354 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Msx3P70354 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Msx3P70354 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msx3P70354 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msx3P70354 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msx3P70354 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Msx3P70354 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msx3P70354 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Msx3P70354 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Msx3P70354 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Msx3P70354 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Msx3P70354 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Msx3P70354 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Msx3P70354 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Msx3P70354 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Msx3P70354 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Msx3P70354 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Msx3P70354 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Msx3P70354 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Msx3P70354 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Msx3P70354 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Msx3P70354 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Msx3P70354 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Msx3P70354 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Msx3P70354 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Msx3P70354 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Msx3P70354 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Msx3P70354 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Msx3P70354 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 156 ms