Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acta1P68134 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acta1P68134 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acta1P68134 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acta1P68134 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Acta1P68134 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acta1P68134 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acta1P68134 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acta1P68134 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Acta1P68134 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acta1P68134 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acta1P68134 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Acta1P68134 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Acta1P68134 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Acta1P68134 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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